Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED28Q9H204 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MED28Q9H204 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms