Protein–RNA interactions for Protein: Q9H165

BCL11A, B-cell lymphoma/leukemia 11A, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11AQ9H165 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCL11AQ9H165 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.56■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BCL11AQ9H165 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms