Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP8Q9BV40 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VAMP8Q9BV40 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms