Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB6Q9BUF5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms