Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms