Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RUFY1Q96T51 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms