Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
TRAPPC9Q96Q05 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRAPPC9Q96Q05 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 789.9 ms