Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C9orf72Q96LT7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9orf72Q96LT7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms