Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LIN37Q96GY3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LIN37Q96GY3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms