Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM44Q96DX7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM44Q96DX7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms