Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C15orf40Q8WUR7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C15orf40Q8WUR7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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