Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPPL3Q8TCT6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPPL3Q8TCT6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms