Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGSF1Q8N6C5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
IGSF1Q8N6C5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms