Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SMIM20Q8N5G0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMIM20Q8N5G0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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