Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPFIBP1Q86W92 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PPFIBP1Q86W92 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PPFIBP1Q86W92 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms