Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCA5Q86VQ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LCA5Q86VQ0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms