Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PACS2Q86VP3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PACS2Q86VP3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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