Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDXQ7Z353 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDXQ7Z353 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms