Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKN3Q6P5Z2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKN3Q6P5Z2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms