Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG16L1Q676U5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ATG16L1Q676U5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms