Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
USPL1Q5W0Q7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms