Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFTN2Q52LD8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFTN2Q52LD8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms