Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
HERC1Q15751 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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