Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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IRF4Q15306 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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IRF4Q15306 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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IRF4Q15306 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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IRF4Q15306 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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IRF4Q15306 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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IRF4Q15306 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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IRF4Q15306 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
IRF4Q15306 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IRF4Q15306 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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