Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NR1I3Q14994 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NR1I3Q14994 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NR1I3Q14994 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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