Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GPNMBQ14956 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GPNMBQ14956 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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