Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TCIRG1Q13488 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TCIRG1Q13488 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCIRG1Q13488 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
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