Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 WDR48-203ENST00000420940 3772 ntTSL 1 (best)6.27□□□□□ -1.412e-10■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 PABPC4-225ENST00000531243 532 ntTSL 425.07■■□□□ 1.61e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.027e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.894e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.554e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.414e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-216ENST00000639335 1327 ntTSL 517.13■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-220ENST00000640060 1895 ntTSL 516.47■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-211ENST00000638559 1369 ntTSL 515.27■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-221ENST00000640201 1972 ntTSL 515.06■□□□□ 04e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-210ENST00000626637 1774 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-223ENST00000640752 5948 ntTSL 513.69□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-215ENST00000639146 1964 ntTSL 513.6□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-213ENST00000638648 1910 ntTSL 212.29□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-219ENST00000640048 1670 ntTSL 511.06□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-218ENST00000639784 1355 ntTSL 510.81□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-217ENST00000639698 1507 ntTSL 510.18□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-208ENST00000515462 3235 ntTSL 28.99□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 HADH-207ENST00000514776 6541 ntTSL 28.58□□□□□ -1.044e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 RALA-201ENST00000005257 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.295e-6■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 RPS15A-211ENST00000575669 3828 nt8.42□□□□□ -1.062e-9■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 RPL22-206ENST00000480661 2279 ntTSL 1 (best)22.65■■□□□ 1.224e-48■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 RPL22-203ENST00000465335 806 ntTSL 319■□□□□ 0.634e-48■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 RPL22-202ENST00000462296 600 ntTSL 310.19□□□□□ -0.784e-48■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.954e-48■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 RPL22-205ENST00000471204 524 ntTSL 24.93□□□□□ -1.624e-48■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 CNPY2-207ENST00000551276 556 ntTSL 523.2■■□□□ 1.36e-12■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 CNPY2-210ENST00000551720 586 ntTSL 323.2■■□□□ 1.36e-12■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 CNPY2-206ENST00000548013 817 ntTSL 1 (best)21.67■■□□□ 1.066e-12■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 CNPY2-208ENST00000551286 484 ntTSL 520.78■□□□□ 0.926e-12■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 CNPY2-211ENST00000553164 666 ntTSL 519.78■□□□□ 0.766e-12■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 CNPY2-202ENST00000546388 670 ntTSL 1 (best)19.32■□□□□ 0.686e-12■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 CNPY2-209ENST00000551475 674 ntTSL 514.04□□□□□ -0.166e-12■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 CNPY2-205ENST00000547570 624 ntTSL 313.33□□□□□ -0.286e-12■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.984e-8■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.039e-11■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 DMAC1-202ENST00000469050 458 ntTSL 313.42□□□□□ -0.269e-11■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 DMAC1-203ENST00000484082 547 ntTSL 55.65□□□□□ -1.59e-11■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.663e-7■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 METTL26-210ENST00000565799 716 ntTSL 325.95■■□□□ 1.742e-11■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.464e-10■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.672e-8■■■■■ 28.2
PABPC4Q13310 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.62e-8■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 PET100-206ENST00000601829 317 ntTSL 214.54□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 PET100-205ENST00000601406 332 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RPL18A-202ENST00000597648 683 ntTSL 316.95■□□□□ 0.31e-18■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.181e-18■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.738e-7■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.038e-7■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ZNRF1-210ENST00000568844 5331 nt15.04■□□□□ -08e-7■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 HSPBP1-204ENST00000585927 666 ntTSL 531.09■■■□□ 2.573e-7■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 AAMP-209ENST00000489767 1833 ntTSL 517.81■□□□□ 0.444e-8■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 AAMP-208ENST00000475678 2270 ntTSL 217.77■□□□□ 0.444e-8■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.394e-8■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.154e-8■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.645e-69■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ATP5B-204ENST00000548474 449 ntTSL 37.38□□□□□ -1.235e-69■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RNF130-204ENST00000520911 1790 ntTSL 1 (best)32.66■■■□□ 2.826e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.616e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MAP7D1-208ENST00000487114 890 ntTSL 230.96■■■□□ 2.556e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.56e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MAP7D1-213ENST00000532131 771 ntTSL 530.53■■■□□ 2.486e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.36e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 KIFC3-219ENST00000565270 1081 ntTSL 529.39■■■□□ 2.36e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.266e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.256e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SHARPIN-209ENST00000534242 933 ntTSL 227.99■■■□□ 2.076e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 GNPTG-205ENST00000527168 1317 ntTSL 527.74■■■□□ 2.036e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.946e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.856e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RNASEH2B-211ENST00000637648 547 ntTSL 326.25■■□□□ 1.796e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.726e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.76e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.676e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.636e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 HOMEZ-202ENST00000558278 563 ntTSL 425.14■■□□□ 1.626e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.566e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.556e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.36e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 GPAA1-209ENST00000527653 856 ntTSL 222.86■■□□□ 1.256e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.26e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 AGTRAP-211ENST00000494437 976 ntTSL 322.54■■□□□ 1.26e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RALA-205ENST00000468201 705 ntTSL 422.44■■□□□ 1.186e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.166e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.166e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MAP7D1-209ENST00000487131 733 ntTSL 522.23■■□□□ 1.156e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 RALA-203ENST00000436179 882 ntTSL 221.83■■□□□ 1.096e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SHARPIN-203ENST00000525275 521 ntTSL 321.68■■□□□ 1.066e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 16e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.936e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.916e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SHMT2-225ENST00000556798 525 ntTSL 220.62■□□□□ 0.896e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 SPRED2-207ENST00000452315 1365 ntTSL 1 (best)20.08■□□□□ 0.816e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 DMPK-214ENST00000598191 732 ntTSL 320.05■□□□□ 0.86e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.796e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 FAM193B-204ENST00000505569 1870 ntTSL 1 (best)19.89■□□□□ 0.776e-6■■■■■ 28.1
PABPC4Q13310 FAM193B-219ENST00000524677 1916 ntTSL 219.74■□□□□ 0.756e-6■■■■■ 28.1
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