Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SRSF5Q13243 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRSF5Q13243 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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