Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CBX3Q13185 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CBX3Q13185 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CBX3Q13185 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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