Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DSC1Q08554 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DSC1Q08554 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms