Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX4Q06945 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms