Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTAG1AP78358 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTAG1AP78358 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms