Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACLYP53396 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACLYP53396 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACLYP53396 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACLYP53396 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACLYP53396 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACLYP53396 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACLYP53396 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACLYP53396 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACLYP53396 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ACLYP53396 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ACLYP53396 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ACLYP53396 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACLYP53396 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACLYP53396 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACLYP53396 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACLYP53396 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACLYP53396 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACLYP53396 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACLYP53396 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACLYP53396 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACLYP53396 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACLYP53396 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACLYP53396 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACLYP53396 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACLYP53396 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACLYP53396 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACLYP53396 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACLYP53396 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACLYP53396 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACLYP53396 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACLYP53396 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACLYP53396 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACLYP53396 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACLYP53396 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACLYP53396 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACLYP53396 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACLYP53396 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACLYP53396 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACLYP53396 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACLYP53396 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACLYP53396 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACLYP53396 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACLYP53396 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACLYP53396 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACLYP53396 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACLYP53396 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACLYP53396 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACLYP53396 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACLYP53396 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms