Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTN2P35609 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN2P35609 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms