Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID4AP29374 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID4AP29374 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID4AP29374 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID4AP29374 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID4AP29374 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARID4AP29374 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms