Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTAFRP25105 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTAFRP25105 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms