Protein–RNA interactions for Protein: P23759

PAX7, Paired box protein Pax-7, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX7P23759 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX7P23759 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX7P23759 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX7P23759 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX7P23759 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX7P23759 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX7P23759 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX7P23759 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX7P23759 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX7P23759 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PAX7P23759 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAX7P23759 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAX7P23759 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAX7P23759 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PAX7P23759 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PAX7P23759 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAX7P23759 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAX7P23759 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAX7P23759 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAX7P23759 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAX7P23759 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX7P23759 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX7P23759 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAX7P23759 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms