Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 MYL4-203ENST00000536623 650 ntTSL 58.61□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 MYL4-209ENST00000573747 640 ntTSL 58.34□□□□□ -1.072e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.059e-9■■■■■ 29
RPS3P23396 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.327e-9■■■■■ 29
RPS3P23396 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.271e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 ALDH16A1-204ENST00000593417 2343 ntTSL 222.13■■□□□ 1.131e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.891e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 ALDH16A1-208ENST00000600265 819 ntTSL 319.15■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 29
RPS3P23396 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 ALDH16A1-207ENST00000599652 3995 ntTSL 213.64□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 CNBP-206ENST00000502372 1026 ntTSL 59.33□□□□□ -0.921e-7■■■■■ 29
RPS3P23396 UPF1-202ENST00000594243 683 ntTSL 314.69□□□□□ -0.065e-8■■■■■ 29
RPS3P23396 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.275e-12■■■■■ 28.9
RPS3P23396 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.315e-12■■■■■ 28.9
RPS3P23396 SLIRP-209ENST00000557342 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.465e-12■■■■■ 28.9
RPS3P23396 SLIRP-211ENST00000557623 865 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.465e-12■■■■■ 28.9
RPS3P23396 SLIRP-212ENST00000613856 420 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.65e-12■■■■■ 28.9
RPS3P23396 SLIRP-205ENST00000556310 626 ntTSL 211.23□□□□□ -0.615e-12■■■■■ 28.9
RPS3P23396 SLIRP-206ENST00000556375 408 ntTSL 211.23□□□□□ -0.615e-12■■■■■ 28.9
RPS3P23396 SLIRP-204ENST00000555890 471 ntTSL 26.7□□□□□ -1.345e-12■■■■■ 28.9
RPS3P23396 PHB-206ENST00000504124 796 ntTSL 512.26□□□□□ -0.452e-9■■■■■ 28.9
RPS3P23396 PHB-202ENST00000393345 847 ntTSL 29.93□□□□□ -0.823e-9■■■■■ 28.9
RPS3P23396 PHB-207ENST00000506273 431 ntTSL 59.87□□□□□ -0.833e-9■■■■■ 28.9
RPS3P23396 PHB-205ENST00000446735 732 ntTSL 59.4□□□□□ -0.93e-9■■■■■ 28.9
RPS3P23396 PHB-204ENST00000434917 534 ntTSL 49.39□□□□□ -0.913e-9■■■■■ 28.9
RPS3P23396 GSN-207ENST00000432226 1042 ntTSL 516.51■□□□□ 0.235e-16■■■■■ 28.9
RPS3P23396 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 28.9
RPS3P23396 XPO7-202ENST00000433566 4519 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 28.9
RPS3P23396 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 28.9
RPS3P23396 HPX-209ENST00000533561 429 ntTSL 511.03□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 28.9
RPS3P23396 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.311e-7■■■■■ 28.9
RPS3P23396 TNFRSF12A-203ENST00000571351 1678 ntTSL 220.24■□□□□ 0.831e-7■■■■■ 28.9
RPS3P23396 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 28.9
RPS3P23396 TNFRSF12A-205ENST00000574699 583 ntTSL 218.71■□□□□ 0.591e-7■■■■■ 28.9
RPS3P23396 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 28.9
RPS3P23396 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 28.9
RPS3P23396 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.331e-12■■■■■ 28.9
RPS3P23396 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.021e-12■■■■■ 28.9
RPS3P23396 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.271e-12■■■■■ 28.9
RPS3P23396 BSG-208ENST00000573784 559 ntTSL 418.5■□□□□ 0.551e-26■■■■■ 28.9
RPS3P23396 IMPDH2-202ENST00000429182 1469 ntTSL 512.3□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 28.8
RPS3P23396 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 28.8
RPS3P23396 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.151e-7■■■■■ 28.8
RPS3P23396 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.121e-7■■■■■ 28.8
RPS3P23396 FARSA-210ENST00000593021 1135 ntTSL 518.18■□□□□ 0.57e-7■■■■■ 28.8
RPS3P23396 GANAB-213ENST00000534422 702 ntTSL 511.21□□□□□ -0.614e-10■■■■■ 28.8
RPS3P23396 PSMD2-212ENST00000473991 590 ntTSL 312.16□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 28.8
RPS3P23396 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 ARHGEF2-203ENST00000361247 4149 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.471e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 ARHGEF2-202ENST00000313695 4080 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 ARHGEF2-214ENST00000477754 883 ntTSL 55.91□□□□□ -1.461e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 RPS10-NUDT3-201ENST00000605528 595 ntTSL 56.67□□□□□ -1.348e-9■■■■■ 28.8
RPS3P23396 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.033e-30■■■■■ 28.8
RPS3P23396 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 BCAT2-204ENST00000593515 1664 ntTSL 516.27■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-6■■■■■ 28.8
RPS3P23396 VARS-223ENST00000474643 885 ntTSL 514.59□□□□□ -0.077e-10■■■■■ 28.8
RPS3P23396 VARS-226ENST00000483275 450 ntTSL 313.2□□□□□ -0.37e-10■■■■■ 28.8
RPS3P23396 APP-214ENST00000466453 374 ntTSL 36.66□□□□□ -1.341e-28■■■■■ 28.8
RPS3P23396 TXNRD1-220ENST00000529751 557 ntTSL 416.6■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 28.7
RPS3P23396 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 28.7
RPS3P23396 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 28.7
RPS3P23396 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.333e-7■■■■■ 28.7
RPS3P23396 APEH-212ENST00000469362 830 ntTSL 310.75□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 28.7
RPS3P23396 LGALS3BP-209ENST00000588205 581 ntTSL 315.33■□□□□ 0.043e-25■■■■■ 28.7
RPS3P23396 CTNNA1-234ENST00000522227 642 ntTSL 310.03□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 28.7
RPS3P23396 CTNNA1-240ENST00000523912 545 ntTSL 48.54□□□□□ -1.045e-7■■■■■ 28.7
RPS3P23396 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 28.7
RPS3P23396 NDUFA11-204ENST00000591341 403 ntTSL 215.65■□□□□ 0.13e-12■■■■■ 28.7
RPS3P23396 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 28.7
RPS3P23396 MMADHC-201ENST00000303319 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 28.7
RPS3P23396 MMADHC-202ENST00000422782 1462 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.132e-7■■■■■ 28.7
RPS3P23396 ENO1-202ENST00000464920 2266 ntTSL 1 (best)12.97□□□□□ -0.336e-41■■■■■ 28.7
RPS3P23396 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)18.56■□□□□ 0.563e-11■■■■■ 28.7
RPS3P23396 TCF12-210ENST00000558908 553 ntTSL 417.97■□□□□ 0.473e-11■■■■■ 28.7
RPS3P23396 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 28.7
RPS3P23396 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 28.7
RPS3P23396 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.363e-11■■■■■ 28.7
RPS3P23396 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 212.66□□□□□ -0.383e-11■■■■■ 28.7
RPS3P23396 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.543e-11■■■■■ 28.7
RPS3P23396 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.573e-11■■■■■ 28.7
RPS3P23396 RFC2-204ENST00000470266 881 ntTSL 510.09□□□□□ -0.793e-11■■■■■ 28.7
RPS3P23396 ITM2A-201ENST00000373298 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-11■■■■■ 28.7
RPS3P23396 PHB-212ENST00000512041 694 ntTSL 39.01□□□□□ -0.973e-9■■■■■ 28.7
RPS3P23396 ITM2A-206ENST00000482194 523 ntTSL 28.75□□□□□ -1.013e-11■■■■■ 28.7
RPS3P23396 ITM2A-205ENST00000469541 879 ntTSL 28.61□□□□□ -1.033e-11■■■■■ 28.7
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