Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERBB3P21860 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERBB3P21860 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms