Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EPHA1P21709 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EPHA1P21709 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms