Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARF4P18085 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARF4P18085 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF4P18085 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF4P18085 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF4P18085 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF4P18085 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF4P18085 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF4P18085 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF4P18085 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARF4P18085 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARF4P18085 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARF4P18085 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARF4P18085 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ARF4P18085 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF4P18085 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF4P18085 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF4P18085 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF4P18085 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF4P18085 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF4P18085 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF4P18085 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF4P18085 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF4P18085 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARF4P18085 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF4P18085 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF4P18085 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF4P18085 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF4P18085 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF4P18085 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF4P18085 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF4P18085 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF4P18085 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARF4P18085 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARF4P18085 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF4P18085 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF4P18085 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF4P18085 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF4P18085 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF4P18085 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF4P18085 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF4P18085 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF4P18085 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF4P18085 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF4P18085 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARF4P18085 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARF4P18085 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms