Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2BP0DI82 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2BP0DI82 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2BP0DI82 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2BP0DI82 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2BP0DI82 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2BP0DI82 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2BP0DI82 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2BP0DI82 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC2BP0DI82 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms