Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
C4AP0C0L4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
C4AP0C0L4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms