Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MGPP08493 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MGPP08493 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MGPP08493 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MGPP08493 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MGPP08493 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MGPP08493 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MGPP08493 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms