Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPM2P07951 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPM2P07951 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TPM2P07951 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TPM2P07951 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM2P07951 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM2P07951 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM2P07951 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM2P07951 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM2P07951 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM2P07951 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM2P07951 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM2P07951 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM2P07951 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TPM2P07951 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TPM2P07951 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TPM2P07951 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPM2P07951 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM2P07951 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM2P07951 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms