Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSDE1O75534 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSDE1O75534 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms