Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATMINO43313 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMINO43313 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMINO43313 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMINO43313 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMINO43313 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMINO43313 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMINO43313 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMINO43313 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMINO43313 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATMINO43313 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATMINO43313 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATMINO43313 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATMINO43313 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATMINO43313 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATMINO43313 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATMINO43313 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATMINO43313 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATMINO43313 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATMINO43313 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATMINO43313 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATMINO43313 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATMINO43313 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATMINO43313 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMINO43313 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMINO43313 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMINO43313 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMINO43313 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMINO43313 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMINO43313 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMINO43313 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMINO43313 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMINO43313 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATMINO43313 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMINO43313 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMINO43313 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMINO43313 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMINO43313 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMINO43313 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMINO43313 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMINO43313 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMINO43313 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMINO43313 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATMINO43313 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATMINO43313 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms