Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPINT1O43278 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPINT1O43278 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms