Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUPL2O15504 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NUPL2O15504 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms